日御碕神社位於島根半島最西端的海岬日御碕，歷史上在《出雲國風土記》中被記載為「美佐伎社」，這座神社由兩座主社合二為一而成。進入樓門後，正面可見下之本社「日沉宮」，而右側的小高台則是上之本社「神之宮」，傳說中與守護白晝的伊勢神宮相對應，是一座守護日本夜晚的神社。

神社的鳥居以花崗岩建造，隨後是朱紅色的樓門和採用「權現造」建築樣式的神社。現今所見的建築是由德川家光下令建造，並由幕府派遣工匠施工，至今仍完美保留著朱紅色的神殿、精緻細膩的雕刻，以及由狩野派和土佐派畫匠們所繪製的壁畫，每一幅都令人嘆為觀止。作為珍貴的神社建築物，包括神殿在內的14座建築已被指定為國家重要文化財產。

沿著從稻佐之濱通往日御碕燈塔的日御碕街道眺望，赤紅色的神殿在蔚藍的日本海和翠綠的松樹林襯托下，如同海底龍宮般熠熠生輝，因此日御碕神社也被譽為「龍宮城」。神社不遠處的經島以黑尾鷗的繁殖地而聞名，每年冬季都吸引許多黑尾鷗來此越冬，成為這裡的另一大自然景觀。